Como asocio una bd mysql a un dominio?

Hola a todos:

Necesito ayuda por la cual os quedaría muy agradecida, tengo un script instalado en un dominio, en otro dominio he copiado el script y ahora lo tengo en los dos, tambien he copiado la base de datos, pero la segunda base de datos no sé como asociarla al segundo dominio con su script, me podeis decir como hacerlo?
Se me asocia a la primera base de datos y necesito que sea a la que he creado.

Muchisimas gracias por vuestras respuestas
Saludos
Si la base de datos esta alojada en el mismo servidor de los 2 dominios es posible hacerlo ingresando la direccion mysql y la bd, pero aveces eso no es posible lo mejor seria crear una bd para tu dominio y exportar los datos de la otra bd e importarlos a la nueva y listo

Saludos!