Duda sobre los inculdes y SEO

Hoa chicos :)
Hoy, mirando por hay, me ha surgido una duda:
¿Influye usar menus los cuales se usan includes al SEO de la web?
(Me refiero, a que si los robots y arañas lo ven como lo que es al final, un enlace, o lo que es al principio, un include, y por lo tanto, no pueden seguir rastreando por la web)

Saludos :)

El PHP es procesado íntegramente por el servidor. Cualquier cliente lo ve como código HTML puro. Los bots son clientes.

Ok, gracias :) Lo preguntaba por que pensaba que se miraban el código directamente, sin" ser "clientes

Es que son clientes. Cualquiera que se conecta a un servidor para recibir respuesta es el cliente de éste.