Subir mi web a public_html

Hola muy buenas. La duda es la siguiente:
En la web que crea el hosting al crear un dominio o subdominio (en mi caso, subdominio), aparecen una serie de carpetas. Según he entendido, nuestra web debemos introducirla en la carpeta llamada public_html. En dicha carpeta ya existen una serie de archivos y carpetas. Aquí es donde tengo la duda. Mi web ya está completa, entonces ¿debo eliminar las carpetas y archivos que aparecen por defecto en la carpeta public_html e introducir mi web, o introducir mis carpetas y archivos directamente en la carpeta public_html mezclados con lo ya existentes?
Gracias por anticipado. Saludos